Sous l’effet des vents, des courants et des apports sédimentaires des fleuves, les eaux du Parc naturel marin offrent des conditions particulièrement favorables à la biodiversité.
Les six principaux écosystèmes de Méditerranée y sont présents et abritent une multitude d’espèces : Fonds sableux, Herbiers de posidonie, Roche infralittorale, Coralligène, Haute mer, Canyons profonds.